RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W

HIR1, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HIR1, Length 2,523 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIR1	YBL008W	DAL80	P26343	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YGL015C	P33199	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	RRT1	P38192	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	GPI18	P38211	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
HIR1	YBL008W	LCB3	P47013	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YML079W	Q03629	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	ATG33	Q06485	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	IMP2	P46972	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	MIX17	Q03667	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	AIM34	Q03673	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	PIN2	Q12057	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	TEL1	P38110	2787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	VAR1	P02381	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	PCL2	P25693	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	FPR2	P32472	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	OXA1	P39952	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	CIN5	P40917	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	SUR7	P54003	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YKL070W	P36087	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	UBC7	Q02159	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	MET32	Q12041	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YNR077C	P53758	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HIR1	YBL008W	YHR140W	P38842	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	MOH1	P38191	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YGR045C	P53229	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	WSC3	Q12215	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YAR1	P46683	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	GPI19	Q04082	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	TIM22	Q12328	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	AGA1	P32323	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	OST2	P46964	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	EOS1	P53938	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	PRM3	Q08931	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YER085C	P40058	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YGL260W	P53056	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YNL190W	P53872	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YKL044W	P36092	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	ATX1	P38636	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YER076C	P40049	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YER181C	P40097	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	SPS100	P13130	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YFL065C	P43539	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	GLO1	P50107	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YIP1	P53039	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	ATP15	P21306	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	TOA2	P32774	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	DSE2	P38844	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	SNA4	Q07549	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	LDB16	P25587	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
HIR1	YBL008W	YGL088W	P53151	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YKR041W	P36134	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YNL092W	P53934	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HIR1	YBL008W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	CMC1	P36064	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	AIM11	P87275	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	MGR2	Q02889	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
HIR1	YBL008W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	HPA2	Q06592	156 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	PFY1	P07274	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YBR209W	P38311	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	ABM1	P47146	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YHL037C	P38733	133 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	ABF2	Q02486	183 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YML122C	Q03207	126 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	CAX4	P53223	239 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	IES6	P32617	166 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HIR1	YBL008W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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