RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	FLT4	P35916	1363 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	SGTA	O43765	313 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA7A	O75326	666 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDH8	O95206	1070 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-ND5	P03915	603 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	ALOX12	P18054	663 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	FBLN1	P23142	703 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MC4R	P32245	332 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MTHFS	P49914	203 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CDR1	P51861	262 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	ARFIP2	P53365	341 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE3A	Q05086	875 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CUL4B	Q13620	913 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	NGEF	Q8N5V2	710 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNN1	Q92952	543 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	GCM1	Q9NP62	436 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS28	Q9UK41	221 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C0S8	307 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ASNA1	O43681	348 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PTP4A3	O75365	173 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ADRB2	P07550	413 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXC9	P31274	260 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATIC	P31939	592 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKAA2	P54646	552 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A3	Q01959	620 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRND	Q07001	517 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K12	Q12852	859 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BECN1	Q14457	450 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE3C	Q15386	1083 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GAREM2	Q75VX8	874 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP53	Q96M91	514 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0232	Q92628	1395 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COL18A1	P39060	1754 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLIT2	O94813	1529 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	THAP12	O43422	761 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	STARD3NL	O95772	234 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MUT	P22033	750 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRB3	P28472	473 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AMPH	P49418	695 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS3	P49796	1198 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHB3	P54753	998 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DLG4	P78352	724 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC42EP1	Q00587	391 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC16	Q13042	620 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.52	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms