RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617199.1

MFGE8-217, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

Gene MFGE8, Length 2,464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-217ENST00000617199 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 MYO1EQ12965 1108 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 IFT88Q13099 833 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 STAT4Q14765 748 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ACAP1Q15027 740 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TTC13Q8NBP0 860 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ACTL9Q8TC94 416 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SAYSD1Q9NPB0 183 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SETD4Q9NVD3 440 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CDH16O75309 829 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CYP3A5P20815 502 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 MIPP30301 263 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PSMC4P43686 418 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 LIG3P49916 1009 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 KCTD6Q8NC69 237 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CCDC134Q9H6E4 229 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ASNSD1Q9NWL6 643 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 GINS2Q9Y248 185 aa13.49□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 HSPH1Q92598 858 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CABS1Q96KC9 395 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TTC25Q96NG3 672 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 MIS12Q9H081 205 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 USP18Q9UMW8 372 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TMEM120BA0PK00 339 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ADCY6O43306 1168 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CD48P09326 243 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 IFNAR2P48551 515 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 STILQ15468 1287 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RFX6Q8HWS3 928 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CNPY3Q9BT09 278 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 DERAQ9Y315 318 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TRIP11Q15643 1979 aa13.48□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 E5RJQ4 531 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 GPD1P21695 349 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PCK1P35558 622 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SNX27Q96L92 541 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CALN1Q9BXU9 219 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 SNTG2Q9NY99 539 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TBK1Q9UHD2 729 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PIK3R2O00459 728 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CREB1P16220 341 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 TAF5Q15542 800 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 VSTM1Q6UX27 236 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 C12orf29Q8N999 325 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 APOC2P02655 101 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 PDGFRAP16234 1089 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 YARSP54577 528 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 CDC42EP1Q00587 391 aa13.46□□□□□ -0.25
MFGE8-217ENST00000617199 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms