RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 HVCN1Q96D96 273 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TPSD1Q9BZJ3 242 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 INVSQ9Y283 1065 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.36■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TNFRSF10BO14763 440 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 CRY1Q16526 586 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TRIM61Q5EBN2 209 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 WHAMMQ8TF30 809 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 GATA6Q92908 595 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 GCNT4Q9P109 453 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 H0Y626 953 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TADA3O75528 432 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TRIM16O95361 564 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 HOXD12P35452 270 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 MAGEA11P43364 429 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SEC13P55735 322 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 TTC30AQ86WT1 665 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SYT12Q8IV01 421 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 DEFB124Q8NES8 71 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.34■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 PKD1L2Q7Z442 2459 aa18.33■□□□□ 0.53
STX4-217ENST00000613541 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 PATE3B3GLJ2 98 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 K7EQS6 105 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 BMP15O95972 392 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 SPINK2P20155 84 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 PPP3CCP48454 512 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 EOGTQ5NDL2 527 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 RABEPKQ7Z6M1 372 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 MDGA1Q8NFP4 955 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 OLIG1Q8TAK6 271 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 CEP76Q8TAP6 659 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 RAD54LQ92698 747 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 SLC22A12Q96S37 553 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 FIZ1Q96SL8 496 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 L1RE1Q9UN81 338 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.33■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 APODP05090 189 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 BCKDHBP21953 392 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ANXA13P27216 316 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 OPRD1P41143 372 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 RBP5P82980 135 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 MCM6Q14566 821 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 VSTM1Q6UX27 236 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 STKLD1Q8NE28 680 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 SPATA17Q96L03 361 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 CACNA1EQ15878 2313 aa18.32■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.31■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 H3BQV1 296 aa18.31■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ITGB3P05106 788 aa18.31■□□□□ 0.52
STX4-217ENST00000613541 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms