RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SLC12A7Q9Y666 1083 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 OBSL1O75147 1896 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DENND4CQ5VZ89 1909 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SYCE3A1L190 88 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 OAZ2O95190 189 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GABRG2P18507 467 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 UCNP55089 124 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 C4orf17Q53FE4 359 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 EEF1DP3Q658K8 133 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 POTEDQ86YR6 584 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 APPL2Q8NEU8 664 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 LXNQ9BS40 222 aa12.66□□□□□ -0.38
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HCG18-241ENST00000602290 HSFX1Q9UBD0 423 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 AK5Q9Y6K8 562 aa12.66□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZFHX3Q15911 3703 aa12.66□□□□□ -0.38
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HCG18-241ENST00000602290 TRIP11Q15643 1979 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB39O15060 712 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TDP2O95551 362 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GNSP15586 552 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 HNF1BP35680 557 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MATKP42679 507 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PPP2R5CQ13362 524 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 EOGTQ5NDL2 527 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MAB21L3Q8N8X9 362 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ATAD1Q8NBU5 361 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GCNAQ96QF7 691 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CD248Q9HCU0 757 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GMIPQ9P107 970 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DNHD1Q96M86 4753 aa12.65□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GTW7 788 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ATP8B1O43520 1251 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 CDC45O75419 566 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 LARGE1O95461 756 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 AFPP02771 609 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 CYP3A7P24462 503 aa12.64□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 NOP2P46087 812 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 DNASE2BQ8WZ79 361 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 HIC2Q96JB3 615 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 RASSF4Q9H2L5 321 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 C6orf50Q9HD87 102 aa12.64□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.64□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 M0QZQ0 153 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 TRIM66O15016 1216 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 TADA3O75528 432 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 F11P03951 625 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 MAOBP27338 520 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 TIE1P35590 1138 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ACTN2P35609 894 aa12.63□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 NLRP12P59046 1061 aa12.63□□□□□ -0.39
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HCG18-241ENST00000602290 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 NFATC3Q12968 1075 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 11.6
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HCG18-241ENST00000602290 TEX35Q5T0J7 233 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 APOA5Q6Q788 366 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ATG14Q6ZNE5 492 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 PGBD3Q8N328 593 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ZNF248Q8NDW4 579 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 TSC1Q92574 1164 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ADPGKQ9BRR6 497 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.63□□□□□ -0.39
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa12.63□□□□□ -0.39
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