RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 PRR29P0C7W0 189 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 27.5
SLC25A39-216ENST00000592857 MTAPQ13126 283 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR44Q5JSH3 913 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TXNDC8Q6A555 127 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MSANTD3Q96H12 275 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SOBPA7XYQ1 873 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PDGFRBP09619 1106 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MYL6P60660 151 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CLDN10P78369 228 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MON1AQ86VX9 555 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 RIN3Q8TB24 985 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 NELL1Q92832 810 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PDXKO00764 312 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM163BP0C2L3 166 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CHRNB1P11230 501 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CTHP32929 405 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PLCB2Q00722 1185 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TNK2Q07912 1038 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 VSTM1Q6UX27 236 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 ADSSL1Q8N142 457 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TTC8Q8TAM2 541 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 PCED1BQ96HM7 432 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 NR3C1P04150 777 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 BDNFP23560 247 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 ATICP31939 592 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 AVPR1AP37288 418 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TNNC1P63316 161 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 DPYDQ12882 1025 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 TRPC3Q13507 836 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 SNX25Q9H3E2 840 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC25A39-216ENST00000592857 RHOBTB3O94955 611 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 VNN1O95497 513 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 TDGF1P13385 188 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 DLG4P78352 724 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 PNOCQ13519 176 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 GAS6Q14393 721 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 TSSK4Q6SA08 328 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 SPATA17Q96L03 361 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC22A12Q96S37 553 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 IER2Q9BTL4 223 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 TSPY26PQ9H489 355 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 HPS4Q9NQG7 708 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 TDP1Q9NUW8 608 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.51■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 AP3M2P53677 418 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 USP46P62068 366 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 CYP27A1Q02318 531 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 GKN1Q9NS71 199 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC25A39-216ENST00000592857 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms