RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BECN1-211ENST00000589636 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.46■□□□□ 0.23
BECN1-211ENST00000589636 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
BECN1-211ENST00000589636 KXD1Q9BQD3 176 aa16.46■□□□□ 0.23
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