RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB21Q9UL25 225 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC3P53804 2025 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN5AQ14524 2016 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 E5RJQ4 531 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC188H7C350 402 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TULP2O00295 520 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 B4GALT3O60512 393 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2C2O75185 946 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 GABBR2O75899 941 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ADORA2BP29275 332 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TKTP29401 623 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 BRCC3P46736 316 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 JOSD2Q8TAC2 188 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RUBCNQ92622 972 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PARD6BQ9BYG5 372 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24■■□□□ 1.43
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CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2C18P33260 490 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 LBX1P52954 281 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL23P55773 120 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R40P59535 323 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM171BQ6P995 826 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PLVAPQ9BX97 442 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ST7Q9NRC1 585 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TET1Q8NFU7 2136 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FGGP02679 453 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CLTBP09497 229 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PYGMP11217 842 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS7P49802 495 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC6A3Q01959 620 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ARCQ7LC44 396 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ABI1Q8IZP0 508 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PKMYT1Q99640 499 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 EPC1Q9H2F5 836 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-207ENST00000589146 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB1P05556 798 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 NPR3P17342 541 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMA2P25787 234 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R5EQ16537 467 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR93Q6P2C0 686 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-207ENST00000589146 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 F8VP50 259 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 I3L4J1 428 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KRIT1O00522 736 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC8A3P57103 927 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 EXD1Q8NHP7 514 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 VWCEQ96DN2 955 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FSCN2O14926 492 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 GPD1P21695 349 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD3Q15059 726 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.95■■□□□ 1.42
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