RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 MYL1P05976 194 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PRR29P0C7W0 189 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 CTHP32929 405 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 GRIK1P39086 918 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 WDR44Q5JSH3 913 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 VSTM1Q6UX27 236 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 NELL1Q92832 810 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.74■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PDXKO00764 312 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 KINO60870 393 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM163BP0C2L3 166 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ATICP31939 592 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 CLDN10P78369 228 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 BIRC3Q13489 604 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 GAS6Q14393 721 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 RIN3Q8TB24 985 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SPATA17Q96L03 361 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC22A12Q96S37 553 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 NR3C1P04150 777 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 DLG4P78352 724 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PON2Q15165 354 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 FSIP1Q8NA03 581 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 HPS4Q9NQG7 708 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 A8MXQ7 604 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 AP3M2P53677 418 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 CDH8P55286 799 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 USP46P62068 366 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 DPYDQ12882 1025 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 IER2Q9BTL4 223 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 EBF3Q9H4W6 596 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A1W2PQ27 194 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A1W2PQ64 194 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A1W2PQD8 194 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 C2orf78A6NCI8 922 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 RHOBTB3O94955 611 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 VNN1O95497 513 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 TDGF1P13385 188 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 ANXA13P27216 316 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CACNA2D1P54289 1103 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 RUNX3Q13761 415 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 NCOA4Q13772 614 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 LRRC32Q14392 662 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF699Q32M78 642 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP135Q66GS9 1140 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 Q6ZS52 159 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 TTC16Q8NEE8 873 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 GCNT4Q9P109 453 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 F8VP50 259 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CLDN5O00501 218 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 LILRB5O75023 590 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CKMP06732 381 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L7P0C7H9 530 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 RAP1GAPP47736 663 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CXCL12P48061 93 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 CCR3P51677 355 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 SATB1Q01826 763 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.69■■□□□ 1.22
CSNK1D-215ENST00000580784 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms