RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RGS4P49798 205 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TWF1Q12792 350 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SCN3BQ9NY72 215 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NFIBO00712 420 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MED24O75448 989 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FLCNQ8NFG4 579 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DLGAP3O95886 979 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MLH1P40692 756 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RUNX1T1Q06455 604 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FAM151AQ8WW52 585 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SGF29Q96ES7 293 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DIABLOQ9NR28 239 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 WHRNQ9P202 907 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA5O75582 802 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00523Q86TU6 105 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH1A1P00352 501 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SELENONQ9NZV5 590 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DYTNA2CJ06 578 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CHRM3P20309 590 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN7P35236 360 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PRLRP16471 622 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF7Q14155 803 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 GLRA3O75311 464 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK1P29120 753 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA13P48723 471 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TROAPQ12815 778 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SEZ6Q53EL9 994 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 BOLA3Q53S33 107 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DDI1Q8WTU0 396 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.144e-7■□□□□ 8.5
PTPRM-211ENST00000580170 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NBNO60934 754 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 APOA4P06727 396 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TGM2P21980 687 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB5P36952 375 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SCTRP47872 440 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HBP1O60381 514 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CASP4P49662 377 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DPP3Q9NY33 737 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ST8SIA6P61647 398 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 POU4F1Q01851 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ORC1Q13415 861 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 C2CD6Q53TS8 623 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RAB14P61106 215 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RDM1Q8NG50 284 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HPSEQ9Y251 543 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RBBP8Q99708 897 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 STRNO43815 780 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 FAM200BP0CF97 657 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 FUT11Q495W5 492 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 YAF2Q8IY57 180 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HES6Q96HZ4 224 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CHD1O14646 1710 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KCNMA1Q12791 1236 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HDDC2Q7Z4H3 204 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SYBUQ9NX95 663 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA9O76027 345 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ALBP02768 609 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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