RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC26A4	O43511	780 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	LRCH4	O75427	683 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	PDGFRB	P09619	1106 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	SAT1	P21673	171 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	MMP8	P22894	467 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	PTP4A2	Q12974	167 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	MFSD5	Q6N075	450 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC125	Q86Z20	511 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	GGA3	Q9NZ52	723 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PRPF8-216	ENST00000577001	KCNN4	O15554	427 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ASMTL	O95671	621 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MT-ND3	P03897	115 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PRKCB	P05771	671 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MIP	P30301	263 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC8A1	P32418	973 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MXRA7	P84157	204 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PLCB4	Q15147	1175 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM13C	Q8NE31	585 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	OTUD5	Q96G74	571 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FBXL18	Q96ME1	805 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PCYT2	Q99447	389 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SDCBP2	Q9H190	292 aa		15.52	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MTA2	O94776	668 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	BAG2	O95816	211 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TGFB2	P61812	414 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	STAT4	Q14765	748 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	STXBP2	Q15833	593 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ALLC	Q8N6M5	410 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	EXD1	Q8NHP7	514 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LPXN	O60711	386 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KRT36	O76013	467 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GCK	P35557	465 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ACAD9	Q9H845	621 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ATP2A1	O14983	1001 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	IQCF3	P0C7M6	154 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GHR	P10912	638 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KCNA3	P22001	575 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GART	P22102	1010 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CDKN2B	P42772	138 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC1A1	P43005	524 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	BPIFB4	P59827	614 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PTK7	Q13308	1070 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CA9	Q16790	459 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RSPH3	Q86UC2	560 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001		A0A0B4J269	797 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MAP3K13	O43283	966 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZMPSTE24	O75844	475 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	T-ENOL	P0DO92	83 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MYBPC2	Q14324	1141 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RILP	Q96NA2	401 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PORCN	Q9H237	461 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	BTBD7	Q9P203	1132 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	BAG6	P46379	1132 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TUB	P50607	506 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	VPS52	Q8N1B4	723 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TTC16	Q8NEE8	873 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MIEF2	Q96C03	454 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PEBP4	Q96S96	227 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CGRRF1	Q99675	332 aa		15.5	■□□□□ 0.07

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