RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHFRQ96EP1 664 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX25Q9H3E2 840 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCB6Q9NP58 842 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXOC1Q9NV70 894 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH9Q9ULB4 789 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB23Q9ULC3 237 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 NME7Q9Y5B8 376 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE4BO95155 1302 aa7.67□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GVL5 298 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 A8MXQ7 604 aa7.66□□□□□ -1.18
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CCNDBP1-212ENST00000567690 K7ESF4 209 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLDN5O00501 218 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXOC3O60645 756 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHACTR2O75167 634 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABL1P00519 1130 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 EGFP01133 1207 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP17L7P0C7H9 530 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFKFB1P16118 471 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANXA13P27216 316 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFNAR2P48551 515 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNA2D1P54289 1103 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRLP54845 237 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 EHHADHQ08426 723 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPEM2Q0P670 501 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP4Q13107 963 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMD2Q13200 908 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ORC1Q13415 861 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRPC3Q13507 836 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUNX3Q13761 415 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCINQ13939 588 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTF1Q14872 753 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF77Q15935 545 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP68Q76N32 757 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF516Q92618 1163 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSANTD3Q96H12 275 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCED1BQ96HM7 432 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 IER2Q9BTL4 223 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNA1AO00555 2505 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 HRO43593 1189 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLRC4O43908 158 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF40O75150 1001 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR29P0C7W0 189 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPRDP23468 1912 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 WEE1P30291 646 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEA11P43364 429 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH8P55286 799 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 STK4Q13043 487 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC6Q16204 474 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF699Q32M78 642 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.65□□□□□ -1.18
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