RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 RUNX3Q13761 415 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 GAS6Q14393 721 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 LPAL2Q16609 132 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 GOLGA5Q8TBA6 731 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2S1Q96SQ9 504 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 EPC1Q9H2F5 836 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-208ENST00000564966 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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PPP4C-208ENST00000564966 LILRB5O75023 590 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 KCNB1Q14721 858 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.07■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 MAMSTRQ6ZN01 415 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 NELL1Q92832 810 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 PAGE5Q96GU1 130 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA32Q96LK8 384 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 MYRFLQ96LU7 910 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 GMEB2Q9UKD1 530 aa27.07■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 CASP4P49662 377 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 AMPD2Q01433 879 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 PCED1BQ96HM7 432 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 FAM83CQ9BQN1 747 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 HPS4Q9NQG7 708 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 OBSL1O75147 1896 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 PFKFB1P16118 471 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 IFNAR2P48551 515 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 FNTBP49356 437 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 MYL6P60660 151 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 MTF1Q14872 753 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 PDGFRLQ15198 375 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 C2orf78A6NCI8 922 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM66O15016 1216 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 TACC1O75410 805 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ABL1P00519 1130 aa27.04■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 KRT85P78386 507 aa27.04■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 WDR44Q5JSH3 913 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 C12orf56Q8IXR9 622 aa27.04■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 CPA6Q8N4T0 437 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF516Q92618 1163 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA17Q96L03 361 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 SLC22A12Q96S37 553 aa27.04■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 EHD2Q9NZN4 543 aa27.04■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 HDCP19113 662 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ATICP31939 592 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 CCINQ13939 588 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF699Q32M78 642 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 RMDN1Q96DB5 314 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 DPEP3Q9H4B8 488 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 WNT6Q9Y6F9 365 aa27.03■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 F8VP50 259 aa27.02■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 PDE6CP51160 858 aa27.02■■□□□ 1.92
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PPP4C-208ENST00000564966 RIN3Q8TB24 985 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 SH3RF2Q8TEC5 729 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 EXOC4Q96A65 974 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 FRYLO94915 3013 aa27.02■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 GPR179Q6PRD1 2367 aa27.01■■□□□ 1.92
PPP4C-208ENST00000564966 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 CMA1P23946 247 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 FOXK2Q01167 660 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF667Q5HYK9 610 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA0895Q8NCT3 520 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 OSCP1Q8WVF1 389 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 MED10Q9BTT4 135 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 USP25Q9UHP3 1055 aa27.01■■□□□ 1.91
PPP4C-208ENST00000564966 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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