RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 CKBP12277 381 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MTA1Q13330 715 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 AKT1P31749 480 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CTNNB1P35222 781 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 HELQQ8TDG4 1101 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.94■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MAPK13O15264 365 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TTC17Q96AE7 1141 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 VAV3Q9UKW4 847 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SELPP16109 830 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 C2CD6Q53TS8 623 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CNPY4Q8N129 248 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GPATCH11Q8N954 259 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 IPMKQ8NFU5 416 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SMAPO00193 183 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RRM1P23921 792 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CLCN6P51797 869 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SPARCL1Q14515 664 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MS4A14Q96JA4 679 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 IGFBP4P22692 258 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 OXCT1P55809 520 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NCAPHQ15003 741 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 IGFLR1Q9H665 355 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 HES2Q9Y543 173 aa15.93■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TRIM66O15016 1216 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ITIH2P19823 946 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NR1D1P20393 614 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC20A1Q8WUM9 679 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TISP43B9A030 160 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ANXA9O76027 345 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 KCNA2P16389 499 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TYK2P29597 1187 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 PPM1AP35813 382 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RALBP11234 206 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TMPRSS15P98073 1019 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 UGP2Q16851 508 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SYTL3Q4VX76 610 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC51AQ86UW1 340 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SPATA24Q86W54 205 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 FAM131BQ86XD5 332 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 GMLQ99445 158 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CFAP99D6REC4 459 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZNF185O15231 689 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CCNE2O96020 404 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RHOCP08134 193 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CDH8P55286 799 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ADIGQ0VDE8 80 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 UNC93AQ86WB7 457 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.92■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 NDUFS3O75489 264 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 CASP2P42575 452 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 KCNA1Q09470 495 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 MICAL2O94851 1124 aa15.91■□□□□ 0.14
LRP1-211ENST00000556356 SMPD1P17405 629 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms