RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.1■■□□□ 1.77
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PRKCH-216ENST00000555542 FAM163BP0C2L3 166 aa26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 MYRFLQ96LU7 910 aa26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 CCL26Q9Y258 94 aa26.09■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 SOBPA7XYQ1 873 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.08■■□□□ 1.77
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PRKCH-216ENST00000555542 DLG4P78352 724 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 TNK2Q07912 1038 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 MTAPQ13126 283 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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PRKCH-216ENST00000555542 SMYD3Q9H7B4 428 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 EHD2Q9NZN4 543 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.08■■□□□ 1.77
PRKCH-216ENST00000555542 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.07■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 LMNAP02545 664 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 NR2F2P24468 414 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CTHP32929 405 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN10P78369 228 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 NUCB2P80303 420 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 FZD5Q13467 585 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC32Q14392 662 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 SPATA17Q96L03 361 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CHRDQ9H2X0 955 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 GKN1Q9NS71 199 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 NME7Q9Y5B8 376 aa26.07■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 PTPRDP23468 1912 aa26.07■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 USP17L7P0C7H9 530 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 RAP1GAPP47736 663 aa26.06■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 PPP2R5DQ14738 602 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ADSSL1Q8N142 457 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TMC2Q8TDI7 906 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 IER2Q9BTL4 223 aa26.06■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.06■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.05■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.05■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 MED10Q9BTT4 135 aa26.05■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.05■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ATP8B3O60423 1300 aa26.05■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.04■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 PON2Q15165 354 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ZACNQ401N2 412 aa26.04■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 CYP2S1Q96SQ9 504 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 HINFPQ9BQA5 517 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 EBF3Q9H4W6 596 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.04■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 F5P12259 2224 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN5O00501 218 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 IKBKBO14920 756 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 PDE6CP51160 858 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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PRKCH-216ENST00000555542 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 SV2AQ7L0J3 742 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 C8orf48Q96LL4 319 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.03■■□□□ 1.76
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