RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 PIRO00625 290 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ASGR1P07306 291 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ATP11AP98196 1134 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF844Q08AG5 666 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 DERAQ9Y315 318 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PTGESO14684 152 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ATP2C2O75185 946 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CAPN2P17655 700 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 AXLP30530 894 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 KCNA10Q16322 511 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MIPP30301 263 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ADCY8P40145 1251 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 PPFIA2O75334 1257 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RPS6KA5O75582 802 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MLH1P40692 756 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RABGGTBP53611 331 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TAP1Q03518 808 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 NME8Q8N427 588 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RNF169Q8NCN4 708 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ATL2Q8NHH9 583 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SMIM23A6NLE4 172 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 CHKAP35790 457 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 CDKN2BP42772 138 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GABRB2P47870 512 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PMS2P54278 862 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ART4Q93070 314 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GAD1Q99259 594 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PDGFRAP16234 1089 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 THPOP40225 353 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PLCB3Q01970 1234 aa22.03■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.03■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 MIOSQ9NXC5 875 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GRIN2DO15399 1336 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.03■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 SEPT4O43236 478 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 LILRA4P59901 499 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 M0QZ92 97 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 ITGA8P53708 1063 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MMRN1Q13201 1228 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SLC29A2Q14542 456 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.02■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 SPC25Q9HBM1 224 aa22.02■■□□□ 1.12
PRDM4-205ENST00000550376 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.02■■□□□ 1.12
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PRDM4-205ENST00000550376 LIASO43766 372 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS4O75173 837 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 TJP3O95049 919 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 LCP1P13796 627 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 KCNE1P15382 129 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 PKDCCQ504Y2 493 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC38Q5VT99 294 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 OSTM1Q86WC4 334 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 KCTD6Q8NC69 237 aa22.01■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 APPL2Q8NEU8 664 aa22.01■■□□□ 1.11
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