RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 TTLL4Q14679 1199 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ADCK1Q86TW2 530 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PRKCIP41743 596 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PEX5P50542 639 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GPR141Q7Z602 305 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 BEST2Q8NFU1 509 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KRT35Q92764 455 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 RGL2O15211 777 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CNDP1Q96KN2 507 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 HACL1Q9UJ83 578 aa20.13■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 LCP1P13796 627 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB5P36952 375 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 XRCC4Q13426 336 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ARMCX1Q9P291 453 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PRKCBP05771 671 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 C4orf22Q6V702 233 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AHCYL1O43865 530 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 WLSQ5T9L3 541 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ABI1Q8IZP0 508 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MPP4Q96JB8 637 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SOX13Q9UN79 622 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AP4S1Q9Y587 144 aa20.12■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TPST1O60507 370 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SCFD2Q8WU76 684 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 FAM200BP0CF97 657 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 STX5Q13190 355 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KCNK18Q7Z418 384 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AGPSO00116 658 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GFAPP14136 432 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM16LQ309B1 348 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 RNF43Q68DV7 783 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ACER1Q8TDN7 264 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 M0R3G1 203 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PSMG1O95456 288 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GPD1P21695 349 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ADRA1DP25100 572 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ACTL9Q8TC94 416 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SEPT3Q9UH03 358 aa20.11■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ENTPD5O75356 428 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KRT8P05787 483 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AADACL2Q6P093 401 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PTPRN2Q92932 1015 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MAML3Q96JK9 1138 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SSTR1P30872 391 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SOX11P35716 441 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MTFR1LQ9H019 292 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CHST7Q9NS84 486 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IMPG1Q17R60 797 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms