RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534602.5

GSDMD-216, Transcript of gasdermin D, humanhuman

TSL 2

Gene GSDMD, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMD-216ENST00000534602 LILRB5O75023 590 aa22.95■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 SOX9P48436 509 aa22.95■■□□□ 1.26
GSDMD-216ENST00000534602 NRLP54845 237 aa22.95■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.95■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.95■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.95■■□□□ 1.26
GSDMD-216ENST00000534602 GKN1Q9NS71 199 aa22.95■■□□□ 1.26
GSDMD-216ENST00000534602 EHD2Q9NZN4 543 aa22.95■■□□□ 1.26
GSDMD-216ENST00000534602 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 TADA3O75528 432 aa22.94■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.94■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.94■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.93■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 KIF20AO95235 890 aa22.92■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.9■■□□□ 1.26
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GSDMD-216ENST00000534602 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GSDMD-216ENST00000534602 CKMP06732 381 aa22.89■■□□□ 1.25
GSDMD-216ENST00000534602 MTF1Q14872 753 aa22.89■■□□□ 1.25
GSDMD-216ENST00000534602 ZNF77Q15935 545 aa22.89■■□□□ 1.25
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GSDMD-216ENST00000534602 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.89■■□□□ 1.25
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