RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.51□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKRD7Q92527 254 aa13.51□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.51□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.51□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC66A2RUB6 948 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 VDRP11473 427 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TWF1Q12792 350 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 VSTM1Q6UX27 236 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 NEK11Q8NG66 645 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SUSD6Q92537 303 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 APOL5Q9BWW9 433 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CD207Q9UJ71 328 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CDH22Q9UJ99 828 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.5□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 F8VZ95 297 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CCL16O15467 120 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SMOQ99835 787 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ACP6Q9NPH0 428 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 COL6A3P12111 3177 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 O00370 1275 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP26A1O43174 497 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 BEST1O76090 585 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT5P13647 590 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ITIH3Q06033 890 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 RAPGEF1Q13905 1077 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CLUL1Q15846 466 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 DDR2Q16832 855 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 FIGNQ5HY92 759 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 BAP1Q92560 729 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 C8orf48Q96LL4 319 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC3Q9BY71 257 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 OGFRQ9NZT2 677 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 C2orf16Q68DN1 1984 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 NOTCH4Q99466 2003 aa13.49□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 MBTPS2O43462 519 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 LRG1P02750 347 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ADORA2BP29275 332 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ALDH1A3P47895 512 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TFF2Q03403 129 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CNGA2Q16280 664 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 PKDCCQ504Y2 493 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SGO2Q562F6 1265 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TTC30AQ86WT1 665 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 TSC1Q92574 1164 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SMARCD1Q96GM5 515 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SPATA17Q96L03 361 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNK16Q96T55 309 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 HHLA1C9JL84 531 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 F8VP50 259 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CBFA2T2O43439 604 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP8B3O60423 1300 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 AP1G2O75843 785 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CD19P15391 556 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 PLD1Q13393 1074 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CLEC20AQ6ZU45 233 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SCN4BQ8IWT1 228 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR152Q8TDT2 470 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 GIPC2Q8TF65 315 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 PSMG2Q969U7 264 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 MED10Q9BTT4 135 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 DUSP16Q9BY84 665 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 KRT82Q9NSB4 513 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 ASB3Q9Y575 518 aa13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4-208ENST00000533628 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms