RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 KCNA4P22459 653 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 WNT7BP56706 349 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 NOMO3P69849 1222 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 PEX6Q13608 980 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 CUL3Q13618 768 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 MCUQ8NE86 351 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 NLRP7Q8WX94 980 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 ATP2A3Q93084 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 PGBD4Q96DM1 585 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 NSL1Q96IY1 281 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 STK32BQ9NY57 414 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 GGA2Q9UJY4 613 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 PSTPIP1O43586 416 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 KRT7P08729 469 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 CALB2P22676 271 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 AP1B1Q10567 949 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 RNF220Q5VTB9 566 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 RASSF3Q86WH2 238 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 STK32AQ8WU08 396 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 MBOAT7Q96N66 472 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 NDE1Q9NXR1 346 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 CACNA1SQ13698 1873 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 ALS2Q96Q42 1657 aa8.59□□□□□ -1.03
RNPC3-208ENST00000533099 H0YCG3 227 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 USP12O75317 370 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 ATP5HO75947 161 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 GTF2A2P52657 109 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 MGAT5Q09328 741 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 NME3Q13232 169 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 TNFAIP1Q13829 316 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 UCMAQ8WVF2 138 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.59□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 PTPRJQ12913 1337 aa8.58□□□□□ -1.04
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RNPC3-208ENST00000533099 WNT10BO00744 389 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 ATP6V1B1P15313 513 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 TRIP10Q15642 601 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 LY6KQ17RY6 165 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 TEX9Q8N6V9 391 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 E2F7Q96AV8 911 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 KLC2Q9H0B6 622 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 AIM2O14862 343 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 MT-CO1P00395 513 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 EGFRP00533 1210 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 OSBPP22059 807 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 PTPN4P29074 926 aa8.58□□□□□ -1.04
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RNPC3-208ENST00000533099 GCNT1Q02742 428 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SLC15A2Q16348 729 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.58□□□□□ -1.04
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RNPC3-208ENST00000533099 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 RNF135Q8IUD6 432 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SGF29Q96ES7 293 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 CPB2Q96IY4 423 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 FGD4Q96M96 766 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 AK5Q9Y6K8 562 aa8.58□□□□□ -1.04
RNPC3-208ENST00000533099 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.58□□□□□ -1.04
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