RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CPA6Q8N4T0 437 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CEP89Q96ST8 783 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS50Q9UI38 385 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CPA4Q9UI42 421 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.92□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KBTBD13C9JR72 458 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 HIP1O00291 1037 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 DNM1LO00429 736 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ATP2A1O14983 1001 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G6O60733 806 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 BCAR3O75815 825 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 FCER1AP12319 257 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KRT85P78386 507 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 GRB14Q14449 540 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KCTD2Q14681 263 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MUM1Q2TAK8 710 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MIIPQ5JXC2 388 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TPH2Q8IWU9 490 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF503Q96F45 646 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ACAP3Q96P50 834 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ADOQ96SZ5 270 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MKS1Q9NXB0 559 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 DPP7Q9UHL4 492 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TMX2Q9Y320 296 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CEP290O15078 2479 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYM6O95789 1325 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 AOX1Q06278 1338 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.91□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 H0Y858 1186 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CABYRO75952 493 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GH2P01242 217 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 VCAM1P19320 739 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EDNRBP24530 442 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADD2P35612 726 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ICA1Q05084 483 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GABPAQ06546 454 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM240Q5SV17 173 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GPR142Q7Z601 462 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 C14orf80Q86SX3 495 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DPP9Q86TI2 863 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 FAM160B2Q86V87 743 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EDAQ92838 391 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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