RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 COX11Q9Y6N1 276 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 KAT6AQ92794 2004 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 DISP1Q96F81 1524 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 PCSK5Q92824 1860 aa5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 MYO1FO00160 1098 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 BTN3A1O00481 513 aa5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 KITP10721 976 aa5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 BMPR2Q13873 1038 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 GBX1Q14549 363 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 PBKQ96KB5 322 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.68□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 EHD3Q9NZN3 535 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 A0A087WWL8 130 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 A6NNZ2 444 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D4O60343 1298 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ELFN1P0C7U0 828 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 LRPAP1P30533 357 aa5.67□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 LILRA4P59901 499 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 CTBP1Q13363 440 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 LLGL1Q15334 1064 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 C14orf80Q86SX3 495 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 FKBP10Q96AY3 582 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SERHLQ9NQF3 203 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 FANCAO15360 1455 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 PROP1O75360 226 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 IGLV2-14P01704 120 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 E2F2Q14209 437 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 TBCCQ15814 346 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SLC15A4Q8N697 577 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 NELL1Q92832 810 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 UROC1Q96N76 676 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 USP19O94966 1318 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA0556O60303 1618 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.66□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 TLR5O60602 858 aa5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 SATB1Q01826 763 aa5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 RNF220Q5VTB9 566 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 APOA5Q6Q788 366 aa5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.65□□□□□ -1.5
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PDE4D-220ENST00000512069 DKK3Q9UBP4 350 aa5.65□□□□□ -1.5
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