RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 STK17AQ9UEE5 414 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 APODP05090 189 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GAD2Q05329 585 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ILKQ13418 452 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PDZD3Q86UT5 571 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 ATP8B3O60423 1300 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP33O14559 1287 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 CKAP5Q14008 2032 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FAM205CA6NFA0 338 aa8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 CYB561D2O14569 222 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ATICP31939 592 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 AP3M2P53677 418 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF445P59923 1031 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 BFSP1Q12934 665 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 LATS1O95835 1130 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT1P36639 197 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 INAVAQ3KP66 663 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 JADE1Q6IE81 842 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 LIG4P49917 911 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ST3GAL1Q11201 340 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 KDM1BQ8NB78 822 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 C8orf76Q96K31 380 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PRORYQ9H606 182 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0C4DFX4 3053 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-210ENST00000503258 VCANP13611 3396 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC169A6NNP5 214 aa8.27□□□□□ -1.09
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