RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497742.6

NICN1-207, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NICN1, Length 1,743 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-207ENST00000497742 HOXA9P31269 272 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 USP8P40818 1118 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 LMAN1P49257 510 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 NDST1P52848 882 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 GCNT1Q02742 428 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CUL2Q13617 745 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 LIN9Q5TKA1 542 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TMEM139Q8IV31 216 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TTC39CQ8N584 583 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 S1PR5Q9H228 398 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 DEF6Q9H4E7 631 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 THEGQ9P2T0 379 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.64□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ATP2C2O75185 946 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 RFPL2O75678 378 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SEC24AO95486 1093 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PON1P27169 355 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ELF1P32519 619 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CORO7P57737 925 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CCDC142Q17RM4 750 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 MAP9Q49MG5 647 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 UBR7Q8N806 425 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 WHAMMQ8TF30 809 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TNIP3Q96KP6 325 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 VPS16Q9H269 839 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CISHQ9NSE2 258 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CD207Q9UJ71 328 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CDC23Q9UJX2 597 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 LGALS16A8MUM7 142 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PRRG1O14668 218 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 KIF5CO60282 957 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 POU2F2P09086 479 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CD58P19256 250 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SLC9A1P19634 815 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TFF2Q03403 129 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ITIH3Q06033 890 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 DUSP4Q13115 394 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TWNKQ96RR1 684 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 ABCB6Q9NP58 842 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.63□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 KCNMA1Q12791 1236 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CLUL1Q15846 466 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 WDR93Q6P2C0 686 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.62□□□□□ -0.55
NICN1-207ENST00000497742 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms