RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113		E5RJQ4	531 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	DPYSL4	O14531	572 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	B3GAT3	O94766	335 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PSMA2	P25787	234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TNFRSF8	P28908	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	GJA8	P48165	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAAP100	Q0VG06	881 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	GPNMB	Q14956	572 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	EXD1	Q8NHP7	514 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SYT15	Q9BQS2	421 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ACBD6	Q9BR61	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	DUSP16	Q9BY84	665 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ST7	Q9NRC1	585 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	LTBP2	Q14767	1821 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PATJ	Q8NI35	1801 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	KRT7	P08729	469 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PYGM	P11217	842 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC130	P13994	396 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	NPR3	P17342	541 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	GPD1	P21695	349 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADORA2B	P29275	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MARCKSL1	P49006	195 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	COPS2	P61201	443 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FUK	Q8N0W3	1084 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CNPY3	Q9BT09	278 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	STIM2	Q9P246	746 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TBX21	Q9UL17	535 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FSCN2	O14926	492 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	HCRT	O43612	131 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PHF2	O75151	1096 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNF8	O76064	485 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	GJB6	O95452	261 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM200B	P0CF97	657 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CHRNA3	P32297	505 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PTPN7	P35236	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	PCK1	P35558	622 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	CLCN6	P51797	869 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TAS2R40	P59535	323 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	OGDH	Q02218	1023 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	TLE2	Q04725	743 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMBIM1-223	ENST00000495113	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

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