RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	GJB5	O95377	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	NPR3	P17342	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ACADSB	P45954	432 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	EPHB4	P54760	987 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	C2CD6	Q53TS8	623 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	IGSF21	Q96ID5	467 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ERBB2	P04626	1255 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PRLR	P16471	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SYN1	P17600	705 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PPM1A	P35813	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PBX3	P40426	434 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	DPF3	Q92784	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MYLPF	Q96A32	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945		E5RJQ4	531 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MYO1F	O00160	1098 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	TULP2	O00295	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CLDN5	O00501	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	ENC1	O14682	589 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	AP1G2	O75843	785 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	FTCD	O95954	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MAN1A1	P33908	653 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SCNN1A	P37088	669 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	RGS7	P49802	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	MESD	Q14696	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-215	ENST00000494945	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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