RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MYCT1Q8N699 235 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NELFBQ8WX92 580 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNN1Q92952 543 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM167AQ96KS9 214 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DEFB118Q96PH6 123 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PARVGQ9HBI0 331 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 INTS13Q9NVM9 706 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KCND2Q9NZV8 630 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CENPFP49454 3210 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 B4GALT5O43286 388 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.334e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-212ENST00000491266 THBDP07204 575 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 COL6A1P12109 1028 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 GAP43P17677 238 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FGFR4P22455 802 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CCNE1P24864 410 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SSTR4P31391 388 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 L1CAMP32004 1257 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CASP4P49662 377 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CPT1AP50416 773 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CDK7P50613 346 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 RTP1P59025 263 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 IKZF1Q13422 519 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PTPN21Q16825 1174 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FRS2Q8WU20 508 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 P2RX5Q93086 422 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 BORCS6Q96GS4 357 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM84AQ96KN4 292 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DMAC2Q9NW81 257 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 COL1A2P08123 1366 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A087WZ62 844 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PQY0 241 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 ARNTLO00327 626 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 IKBKBO14920 756 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 CLIC2O15247 247 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM189A1O60320 539 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 MSCO60682 206 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 GCNT3O95395 438 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 CHRNA1P02708 482 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 FUT4P22083 530 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 GPC3P51654 580 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 PTENP60484 403 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 MGAT3Q09327 533 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 ITGA7Q13683 1181 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF6Q15052 776 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 TCTN1Q2MV58 587 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA1Q5VX52 437 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-212ENST00000491266 ZPBP2Q6X784 338 aa6.71□□□□□ -1.34
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