RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1B0GTH6	734 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019		F8VP50	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PAPLN	O95428	1278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	RHO	P08100	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CSH1	P0DML2	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CSH2	P0DML3	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	UCHL3	P15374	230 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	RFX1	P22670	979 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	FSHR	P23945	695 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CLUH	O75153	1309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF197	O14709	1029 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CALCA	P01258	141 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	BMP1	P13497	986 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SLC8A3	P57103	927 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NR1I3	Q14994	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SHC3	Q92529	594 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CYP26A1	O43174	497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	THAP12	O43422	761 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	MED7	O43513	233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	BEST1	O76090	585 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	FGF19	O95750	216 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	TPM3	P06753	285 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GABRR2	P28476	465 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GNA15	P30679	374 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PTK2	Q05397	1052 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SMO	Q99835	787 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PQC6	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PRU2	124 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	EPHB6	O15197	1021 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NOL4	O94818	638 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	GJA1	P17302	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	NPR3	P17342	541 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF132	P52740	706 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	STIL	Q15468	1287 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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