RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 F11P03951 625 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 THAP9Q9H5L6 903 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 COMMD8Q9NX08 183 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PDE6CP51160 858 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 KCNH2Q12809 1159 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CCDC142Q17RM4 750 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GPR158Q5T848 1215 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ACOT1Q86TX2 421 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FCARP24071 287 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GPR15P49685 360 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CUL2Q13617 745 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM35AQ86V20 835 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM81BQ96LP2 452 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NT5C1BQ96P26 610 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MED10Q9BTT4 135 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CISHQ9NSE2 258 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 F8VP50 259 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GJA1P17302 382 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PSMC3P17980 439 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FUKQ8N0W3 1084 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GPR152Q8TDT2 470 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DNASE1L2Q92874 299 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PTMSP20962 102 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 POTEHQ6S545 545 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MON1AQ86VX9 555 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NUP93Q8N1F7 819 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FBXL6Q8N531 539 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 WHAMMQ8TF30 809 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TATDN2Q93075 761 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 MED15Q96RN5 788 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 KXD1Q9BQD3 176 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 KCNH6Q9H252 994 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TRIOO75962 3097 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NCANO14594 1321 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CLDN5O00501 218 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DPYSL4O14531 572 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 LRRN2O75325 713 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 AP1G2O75843 785 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM200BP0CF97 657 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CD58P19256 250 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 AVPR1AP37288 418 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CDR1P51861 262 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NUBP1P53384 320 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 GCNT1Q02742 428 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 LMO3Q8TAP4 145 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 IRF7Q92985 503 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SHDQ96IW2 340 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms