RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ASB6Q9NWX5 421 aa8.35□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CCDC151A5D8V7 595 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ORC4O43929 436 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 DGKEP52429 567 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 CACNA2D1P54289 1103 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 TREML2Q5T2D2 321 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.34□□□□□ -1.07
SGCE-210ENST00000472326 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 RASSF9O75901 435 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 EBLN1P0CF75 366 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 KCNA3P22001 575 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PCSK6P29122 969 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PRKAG1P54619 331 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 DTX2Q86UW9 622 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 GLG1Q92896 1179 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SPSB4Q96A44 273 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 TTC17Q96AE7 1141 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 TTLL1O95922 423 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 FESP07332 822 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 JUPP14923 745 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 BMPR2Q13873 1038 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 F8W8V4 182 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 H7C4K7 107 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 KIF3BO15066 747 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 TLR5O60602 858 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 R3HDM4Q96D70 268 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 HAPLN3Q96S86 360 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 GLOD4Q9HC38 313 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 VNN1O95497 513 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 IL1R1P14778 569 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 KLRC1P26715 233 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PDE6CP51160 858 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ITGA8P53708 1063 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 LY6KQ17RY6 165 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 A1L4Q6 167 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 NXPH3O95157 252 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 GNALP38405 381 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 UROC1Q96N76 676 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SARGQ9BW04 601 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CHST8Q9H2A9 424 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 APAF1O14727 1248 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 C1QL1O75973 258 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 IGLV2-14P01704 120 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 ALDH9A1P49189 494 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-210ENST00000472326 CCT8P50990 548 aa8.28□□□□□ -1.08
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