RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GCNT1Q02742 428 aa14.16□□□□□ -0.14
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SH3BP1-206ENST00000469947 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.155e-10■■■■■ 34.7
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SH3BP1-206ENST00000469947 BST1Q10588 318 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-206ENST00000469947 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-206ENST00000469947 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP1-206ENST00000469947 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.14□□□□□ -0.15
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