RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 APOL6Q9BWW8 343 aa18.05■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 SMIM23A6NLE4 172 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 E5RJQ4 531 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 AKAP5P24588 427 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 P3H1Q32P28 736 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ACOT1Q86TX2 421 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 APBA2Q99767 749 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.04■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 RASGRF2O14827 1237 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ACSL3O95573 720 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ITGAVP06756 1048 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PFKMP08237 780 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 GPD1P21695 349 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 KDELR1P24390 212 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 MIPP30301 263 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CDR1P51861 262 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 OASLQ15646 514 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PTGISQ16647 500 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PRUNE1Q86TP1 453 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 EPN3Q9H201 632 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 AGTP01019 485 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CD4P01730 458 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PCK1P35558 622 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PLCB3Q01970 1234 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TAZQ16635 292 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 UNC93AQ86WB7 457 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TTC13Q8NBP0 860 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 KCTD6Q8NC69 237 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CNPY3Q9BT09 278 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 USP18Q9UMW8 372 aa18.03■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3R2O00459 728 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TTC4O95801 387 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 SETSIPP0DME0 302 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 GNAT1P11488 350 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 ARSEP51690 589 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 DYNLT1P63172 113 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 BBS12Q6ZW61 710 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 IFNL1Q8IU54 200 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
FAAP20-211ENST00000469733 C2CD4BA6NLJ0 364 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFAB1O14561 156 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CST8O60676 142 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CCT5P48643 541 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RGS7P49802 495 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PKDCCQ504Y2 493 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NME8Q8N427 588 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 C7orf31Q8N865 590 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RXFP2Q8WXD0 754 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TSPAN18Q96SJ8 248 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 HESX1Q9UBX0 185 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GJD2Q9UKL4 321 aa18.02■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PDGFRAP16234 1089 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SLCO1A2P46721 670 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TTC30AQ86WT1 665 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 HSPH1Q92598 858 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF560Q96MR9 790 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PWWP2AQ96N64 755 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RNF19AQ9NV58 838 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 KLK14Q9P0G3 267 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms