RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 KCNK16Q96T55 309 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PIDD1Q9HB75 910 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CD207Q9UJ71 328 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CDH22Q9UJ99 828 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.37□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 O00370 1275 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM66O15016 1216 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 XYLBO75191 536 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 BEST1O76090 585 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ANXA13P27216 316 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HOXA9P31269 272 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 STAT1P42224 750 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MAGEA11P43364 429 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF75DP51815 510 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MAP3K7CLP57077 242 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TFF2Q03403 129 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PTK2Q05397 1052 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PLD1Q13393 1074 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CES5AQ6NT32 575 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 RTL10Q7L3V2 364 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 VSTM4Q8IW00 320 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ELMOD1Q8N336 334 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 UBA3Q8TBC4 463 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 BAP1Q92560 729 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 SMOQ99835 787 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CORO1BQ9BR76 489 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 NUP58Q9BVL2 599 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 S1PR5Q9H228 398 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HESX1Q9UBX0 185 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 COG5Q9UP83 839 aa9.36□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 C5orf42Q9H799 3197 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC53A6NM62 1247 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 M0QYV0 167 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MED7O43513 233 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MICAL2O94851 1124 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 GYPCP04921 128 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CFHP08603 1231 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CYP11B1P15538 503 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 NPR3P17342 541 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PDE6CP51160 858 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 BCAT1P54687 386 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 SLC8A3P57103 927 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 BPIFB4P59827 614 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 NTHL1P78549 312 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ITIH3Q06033 890 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MTMR3Q13615 1198 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 VEPH1Q14D04 833 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 STILQ15468 1287 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CNGA2Q16280 664 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TAF12Q16514 161 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 FIGNQ5HY92 759 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TAF3Q5VWG9 929 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TMC6Q7Z403 805 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 GPR149Q86SP6 731 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ITIH5Q86UX2 942 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 TTC30AQ86WT1 665 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PASD1Q8IV76 773 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 PSMG2Q969U7 264 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 C8orf48Q96LL4 319 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 DUSP16Q9BY84 665 aa9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PQJ5 194 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms