RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GPS2Q13227 327 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ORC1Q13415 861 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DSC3Q14574 896 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ACAP1Q15027 740 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 STILQ15468 1287 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SOWAHAQ2M3V2 549 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF394Q53GI3 561 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP58Q5T655 872 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ARCQ7LC44 396 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BNIPLQ7Z465 357 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM110Q86TL2 294 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UNC93AQ86WB7 457 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RELL1Q8IUW5 271 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 IFT81Q8WYA0 676 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEF5Q92565 580 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC45Q96CN5 670 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TLCD1Q96CP7 247 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MCEEQ96PE7 176 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PEBP4Q96S96 227 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FMO2Q99518 471 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DPH5Q9H2P9 285 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CYLDQ9NQC7 956 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 VPS18Q9P253 973 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GABRQQ9UN88 632 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HES2Q9Y543 173 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TULP2O00295 520 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GABRDO14764 452 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 INPPL1O15357 1258 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LIASO43766 372 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OPA1O60313 960 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HSF2BPO75031 334 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KRT14P02533 472 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MYL3P08590 195 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KRT19P08727 400 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 P4HA1P13674 534 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CD19P15391 556 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SREBF2Q12772 1141 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM32Q13049 653 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR3Q13615 1198 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SGO2Q562F6 1265 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TFDP3Q5H9I0 405 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM26DQ5JW98 314 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PMF1Q6P1K2 205 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BBS12Q6ZW61 710 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OSTM1Q86WC4 334 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 VSIG1Q86XK7 387 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC102AQ96A19 550 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms