RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM136AQ96C01 138 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 DKK4Q9UBT3 224 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C4K7 107 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FFAR2O15552 330 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNQ3O43525 872 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 C1SP09871 688 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNA3P22001 575 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ICA1Q05084 483 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ITIH3Q06033 890 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MIIPQ5JXC2 388 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FCRL6Q6DN72 434 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC46Q96FV0 321 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CRB3Q9BUF7 120 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC23Q9UJX2 597 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087WV62 115 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS10O43665 173 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PIAS2O75928 621 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDEFO95238 335 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RASAL1O95294 804 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GATA3P23771 443 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKAR1BP31321 381 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE6CP51160 858 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 NXPH1P58417 271 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SKAP1Q86WV1 359 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF527Q8NB42 609 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF503Q96F45 646 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GDF15Q99988 308 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM5Q9C035 493 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CREB3O43889 395 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH9A1P49189 494 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CCNIQ14094 377 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LNX2Q8N448 690 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR20Q99678 358 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PODXLO00592 558 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PROM1O43490 865 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TLR5O60602 858 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ADRB1P08588 477 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GABRB3P28472 473 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TP53BP2Q13625 1128 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPAQ15257 358 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR149Q86SP6 731 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DTX2Q86UW9 622 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MUL1Q969V5 352 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PGBD1Q96JS3 809 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM227BQ96M60 508 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RGL1Q9NZL6 768 aa6.61□□□□□ -1.35
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