RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446312.5

DDR1-238, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, human

TSL 5 BASIC

Gene DDR1, Length 3,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDR1-238	ENST00000446312		B2RBV5	119 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312		H7C0C1	242 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	RGL2	O15211	777 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KRT34	O76011	436 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TMEM63A	O94886	807 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ELK3	P41970	407 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PHKA2	P46019	1235 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ATP5O	P48047	213 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CD151	P48509	253 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	RGS7	P49802	495 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PRKCE	Q02156	737 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CENPU	Q71F23	418 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312		K7ERI5	159 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PGGT1B	P53609	377 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NOMO3	P69849	1222 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CUL2	Q13617	745 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NCOA4	Q13772	614 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CCNG2	Q16589	344 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CLUH	O75153	1309 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	IL1R2	P27930	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	GPC3	P51654	580 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PGM5	Q15124	567 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KLRC2	P26717	231 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ARL4C	P56559	192 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	RIT2	Q99578	217 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TBX10	O75333	385 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	TOM1L1	O75674	476 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PDE5A	O76074	875 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	GJA8	P48165	433 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	NUMB	P49757	651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PTK7	Q13308	1070 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	RIPK1	Q13546	671 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDR1-238	ENST00000446312	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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