RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACSL3O95573 720 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BRAFP15056 766 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAV1Q03135 178 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BLMHQ13867 455 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PARP6Q2NL67 630 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RMDN2Q96LZ7 410 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHB18PQ96TA0 734 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP5HO75947 161 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MCF2P10911 925 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CALRP27797 417 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MGAT5Q09328 741 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PXYLP1Q8TE99 480 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KAT5Q92993 513 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPDL1Q96EA4 605 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.14■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPOPO43791 374 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ASGR1P07306 291 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHRNB2P17787 502 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IVDP26440 423 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STX2P32856 288 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHKAP35790 457 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT17Q04695 432 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNA10Q16322 511 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM192Q8IY95 271 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLHDC9Q8NEP7 349 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNF8Q96H20 258 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NT5C1BQ96P26 610 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HLA-DRAP01903 254 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAN1A1P33908 653 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PIK3CAP42336 1068 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTK6Q13882 451 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR49Q8IV35 697 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FBF1Q8TES7 1133 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLVAPQ9BX97 442 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 E7ENQ6 273 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VNN1O95497 513 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXCL8P10145 99 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SURF1Q15526 300 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GDAP1Q8TB36 358 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HELQQ8TDG4 1101 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM33Q9UPN9 1127 aa18.12■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM170AA1A519 330 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A6NHS1 94 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAG3L1P0CL83 205 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAC1P20366 129 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX9Q8N6V9 391 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUP85Q9BW27 656 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRMDAQ9H2I8 198 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GCKP35557 465 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AP3M2P53677 418 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MFAP3P55082 362 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SGO2Q562F6 1265 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RELL1Q8IUW5 271 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.11■□□□□ 0.49
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms