RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RNF186Q9NXI6 227 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC130P13994 396 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA10Q16322 511 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RAB6CQ53S08 254 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CENPHQ9H3R5 247 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 H0YGN5 161 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PPFIA2O75334 1257 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TAF6P49848 677 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TAF5Q15542 800 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CCNG2Q16589 344 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TRNP1Q6NT89 227 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SERINC5Q86VE9 423 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ATL2Q8NHH9 583 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LPPQ93052 612 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF560Q96MR9 790 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 NFS1Q9Y697 457 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH1A1P00352 501 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ADORA2BP29275 332 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CDKN2BP42772 138 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 MTMR3Q13615 1198 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PKDCCQ504Y2 493 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RSPH3Q86UC2 560 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KIF3CO14782 793 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PDE4CQ08493 712 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF844Q08AG5 666 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CALCOCO2Q13137 446 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 STILQ15468 1287 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 APPL2Q8NEU8 664 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ART4Q93070 314 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 HESX1Q9UBX0 185 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TP73O15350 636 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TJP3O95049 919 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GAS8O95995 478 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CD48P09326 243 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 MIPP30301 263 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 THPOP40225 353 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 MLH1P40692 756 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LILRA4P59901 499 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 DYNLT1P63172 113 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CDO1Q16878 200 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 UNC93AQ86WB7 457 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SNX25Q9H3E2 840 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.39■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ERICH4A6NGS2 130 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PTK6Q13882 451 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC142Q17RM4 750 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC25Q86WR0 208 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN2DO15399 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GABBR2O75899 941 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PDGFRAP16234 1089 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GBP1P32455 592 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PMS2P54278 862 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 HSPH1Q92598 858 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GAD1Q99259 594 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 MIS12Q9H081 205 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 RNF8O76064 485 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 KRT7P08729 469 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY8P40145 1251 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PNPLA4P41247 253 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SP3Q02447 781 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 NOGQ13253 232 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SV2CQ496J9 727 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms