RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SDHBP21912 280 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TGM1P22735 817 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 LMO2P25791 158 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 USP4Q13107 963 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MTF1Q14872 753 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF77Q15935 545 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 EBF3Q9H4W6 596 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP45Q9UL16 551 aa22.44■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 LRP3O75074 770 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TNNI1P19237 187 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ME1P48163 572 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PDE6CP51160 858 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 LMNB2Q03252 620 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PCED1BQ96HM7 432 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 EHD2Q9NZN4 543 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT4Q9P109 453 aa22.43■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM66O15016 1216 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CLIC2O15247 247 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CKMP06732 381 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ATICP31939 592 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FNTBP49356 437 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2J2P51589 502 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP8P85298 464 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 DMWDQ09019 674 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RDH13Q8NBN7 331 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC4Q96A65 974 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MMS19Q96T76 1030 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.42■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RETP07949 1114 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 BDNFP23560 247 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CASP1P29466 404 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CUL4BQ13620 913 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CPA6Q8N4T0 437 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf48Q96LL4 319 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A12Q96S37 553 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.41■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 HRO43593 1189 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ATG13O75143 517 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLFN14P0C7P3 912 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARSAP15289 507 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 DRD1P21728 446 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA13P27216 316 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 GRIK1P39086 918 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 PPP3CCP48454 512 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 TNNC1P63316 161 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CYP27A1Q02318 531 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 KCNB1Q14721 858 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO43Q4G163 708 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2A3Q93084 1043 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SNX25Q9H3E2 840 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 ECT2Q9H8V3 914 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 NME7Q9Y5B8 376 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 CEP250Q9BV73 2442 aa22.4■■□□□ 1.18
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf78A6NCI8 922 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PDGFRBP09619 1106 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 GJA4P35212 333 aa22.39■■□□□ 1.17
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