RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM107AO95990 144 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRJ-201ENST00000418331 PKP3Q9Y446 797 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF286BP0CG31 522 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 TGM2P21980 687 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS4P49798 205 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 FOPNLQ96NB1 174 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 CPA4Q9UI42 421 aa22.24■■□□□ 1.15
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