RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ACSL3O95573 720 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ITGAVP06756 1048 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 MAP2K2P36507 400 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ADAM17P78536 824 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 MYO1EQ12965 1108 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 P3H1Q32P28 736 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 NLRP14Q86W24 1093 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 SNTG2Q9NY99 539 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 TULP2O00295 520 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 PFKMP08237 780 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 UBA3Q8TBC4 463 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 CENPTQ96BT3 561 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 PWWP2AQ96N64 755 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ZWILCHQ9H900 591 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 SMIM23A6NLE4 172 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 KDELR1P24390 212 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 MAP2K5Q13163 448 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 HIC1Q14526 733 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 KYNUQ16719 465 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 NOTUMQ6P988 496 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 GINS2Q9Y248 185 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-204ENST00000413164 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PPEF2O14830 753 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TCEA3O75764 348 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 SLCO1A2P46721 670 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 STILQ15468 1287 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PKDCCQ504Y2 493 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 BBS12Q6ZW61 710 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 SERPINB12Q96P63 405 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 OSMRQ99650 979 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 GMNCA6NCL1 334 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 E7EVH7 732 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TRPA1O75762 1119 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 MIPP30301 263 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PCK1P35558 622 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TLK2Q86UE8 772 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 C12orf29Q8N999 325 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 MDM1Q8TC05 714 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CNTN3Q9P232 1028 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 HAS3O00219 553 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP2C9P11712 490 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ARSEP51690 589 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 LONRF1Q17RB8 773 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TRNP1Q6NT89 227 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 HAUS1Q96CS2 278 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 HES2Q9Y543 173 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 NME7Q9Y5B8 376 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CDR1P51861 262 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PPARDQ03181 441 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 MFSD10Q14728 455 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 USP18Q9UMW8 372 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 E5RJQ4 531 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 MYO1CO00159 1063 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CST8O60676 142 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 RNF8O76064 485 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CD48P09326 243 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 ETS1P14921 441 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC142Q17RM4 750 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms