RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 LRRC14Q15048 493 aa24.98■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SPATA21Q7Z572 469 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CDT1Q9H211 546 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ASB7Q9H672 318 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.98■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 MGRN1O60291 552 aa24.97■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 RAD23BP54727 409 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ZNF394Q53GI3 561 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.97■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 LRCH4O75427 683 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 RNF43Q68DV7 783 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 MROH8Q9H579 483 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 P4HA1P13674 534 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 KDELR1P24390 212 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 WDR78Q5VTH9 848 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 GPR142Q7Z601 462 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 XYLT1Q86Y38 959 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.96■■□□□ 1.59
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PMS1-205ENST00000409985 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.96■■□□□ 1.59
PMS1-205ENST00000409985 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.95■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SGK1O00141 431 aa24.95■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 HMGCRP04035 888 aa24.95■■□□□ 1.58
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PMS1-205ENST00000409985 MARK3P27448 753 aa24.95■■□□□ 1.58
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PMS1-205ENST00000409985 PCK1P35558 622 aa24.95■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 PHKA2P46019 1235 aa24.95■■□□□ 1.58
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PMS1-205ENST00000409985 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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PMS1-205ENST00000409985 ACTL9Q8TC94 416 aa24.94■■□□□ 1.58
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PMS1-205ENST00000409985 POLIQ9UNA4 740 aa24.94■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 BNIP1Q12981 228 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.93■■□□□ 1.58
PMS1-205ENST00000409985 TRIM50Q86XT4 487 aa24.93■■□□□ 1.58
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