RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SGO2Q562F6 1265 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 GJB7Q6PEY0 223 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 FAM35AQ86V20 835 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 FUKQ8N0W3 1084 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 GPR152Q8TDT2 470 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SPATA17Q96L03 361 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SIX2Q9NPC8 291 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 EHD2Q9NZN4 543 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.54□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 F8VP50 259 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 MICAL2O94851 1124 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 FAM200BP0CF97 657 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 MYL4P12829 197 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 KRT5P13647 590 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 CD19P15391 556 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 RFX1P22670 979 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 ADORA2BP29275 332 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 APBA1Q02410 837 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VPREB1-202ENST00000403807 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 USP8P40818 1118 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 EPHA5P54756 1037 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SLC8A3P57103 927 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NUP93Q8N1F7 819 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 KCNK16Q96T55 309 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 LRRC3Q9BY71 257 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DUSP16Q9BY84 665 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 KRT82Q9NSB4 513 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 HESX1Q9UBX0 185 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.52□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NOL4O94818 638 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UCHL3P15374 230 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GABRR2P28476 465 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CDC25CP30307 473 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CACNA2D1P54289 1103 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MAP3K7CLP57077 242 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 FANCCQ00597 558 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ZP2Q05996 745 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR3Q13615 1198 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SYCP1Q15431 976 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 STILQ15468 1287 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CNGA2Q16280 664 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TMC8Q8IU68 726 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 NEK11Q8NG66 645 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ITFG1Q8TB96 612 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SHC3Q92529 594 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 MYRFLQ96LU7 910 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GCNAQ96QF7 691 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SMOQ99835 787 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 STK33Q9BYT3 514 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 GPR88Q9GZN0 384 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 COMMD8Q9NX08 183 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 CDH7Q9ULB5 785 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.51□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 A0A0C4DFX4 3053 aa14.5□□□□□ -0.09
VPREB1-202ENST00000403807 A0A1B0GTH6 734 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms