RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394149.7

CSF3-204, Transcript of colony stimulating factor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSF3, Length 1,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3-204ENST00000394149 CYP2C18P33260 490 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LBX1P52954 281 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TAS2R40P59535 323 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SUSD3Q96L08 255 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SYT15Q9BQS2 421 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CYLDQ9NQC7 956 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TBX21Q9UL17 535 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CDH9Q9ULB4 789 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 F8VP50 259 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CCDC188H7C350 402 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PIK3R2O00459 728 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 KRIT1O00522 736 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 GABBR2O75899 941 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ITGB1P05556 798 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 AADACL2Q6P093 401 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ABI1Q8IZP0 508 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 HASPINQ8TF76 798 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 HSFY1Q96LI6 401 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CASD1Q96PB1 797 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PNKPQ96T60 521 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PLVAPQ9BX97 442 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 DUSP16Q9BY84 665 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 RAB21Q9UL25 225 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.6□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 HOXA2O43364 376 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TYMPP19971 482 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PSMA2P25787 234 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ACADSBP45954 432 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PLA2G4AP47712 749 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SLC8A3P57103 927 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SLC6A3Q01959 620 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 PLCB3Q01970 1234 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 CCDC142Q17RM4 750 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 LRRC38Q5VT99 294 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 EMC1Q8N766 993 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 KRT12Q99456 494 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ACBD6Q9BR61 282 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 MED10Q9BTT4 135 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CSF3-204ENST00000394149 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 F8W810 466 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 CLDN5O00501 218 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 NPR3P17342 541 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 OR1G1P47890 313 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 ACAP1Q15027 740 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 C8orf74Q6P047 294 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 WDR93Q6P2C0 686 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.58□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 CLTBP09497 229 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 TCF4P15884 667 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 SCNN1AP37088 669 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 BRD3Q15059 726 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.57□□□□□ -0.08
CSF3-204ENST00000394149 FAM171BQ6P995 826 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms