RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.89■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.89■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 A0A1B0GVG6 124 aa20.88■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 F8VP50 259 aa20.88■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.88■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 CISHQ9NSE2 258 aa20.88■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 ALLCQ8N6M5 410 aa20.87■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 EPAS1Q99814 870 aa20.87■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.87■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.86■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 TDRPQ86YL5 185 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 MCEEQ96PE7 176 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 PRKCBP05771 671 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 ITGAVP06756 1048 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 T-ENOLP0DO92 83 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 ADRA1DP25100 572 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 TNFSF9P41273 254 aa20.86■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.86■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 GGA3Q9NZ52 723 aa20.86■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 A0A0G2JND7 137 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 NRLP54845 237 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 ALDH3A1P30838 453 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 PCK1P35558 622 aa20.85■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.85■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 LHX5Q9H2C1 402 aa20.85■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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PAN3-201ENST00000380958 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 ABLIM1O14639 778 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 MED7O43513 233 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 B4GALT4O60513 344 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 LGR5O75473 907 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 MOGSQ13724 837 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 ZNF699Q32M78 642 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.84■□□□□ 0.93
PAN3-201ENST00000380958 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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