RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 GNPATO15228 680 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CLDN3O15551 220 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D12O60347 775 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 IL18RAPO95256 599 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 STAT3P40763 770 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MYBPC2Q14324 1141 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 QPRTQ15274 297 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TTC30AQ86WT1 665 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NIM1KQ8IY84 436 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 C2CD2Q9Y426 696 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NCAM2O15394 837 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PDE8BO95263 885 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SLC39A6Q13433 755 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC185Q8N715 623 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SUN5Q8TC36 379 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SLC20A1Q8WUM9 679 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 DCLK3Q9C098 648 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 KRT34O76011 436 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NNMTP40261 264 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MCL1Q07820 350 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ALX1Q15699 326 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RFX4Q33E94 735 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 AHI1Q8N157 1196 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 K7ERI5 159 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PIK3CDO00329 1044 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MFN2O95140 757 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 AP3S2P59780 193 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 BNIP2Q12982 314 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF235Q14590 738 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CD302Q8IX05 232 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 BHMTQ93088 406 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CLIC2O15247 247 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CYP2C8P10632 490 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PAX7P23759 505 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 HNMTP50135 292 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CDH6P55285 790 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TIMM10P62072 90 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NR1D2Q14995 579 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CHID1Q9BWS9 393 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 AIM2O14862 343 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 BMP10O95393 424 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 S100A6P06703 90 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MSH3P20585 1137 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 GTF2H1P32780 548 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MAPK11Q15759 364 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 XKRXQ6PP77 449 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 FOXO3O43524 673 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ITGA8P53708 1063 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RINLQ6ZS11 566 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 ADSSL1Q8N142 457 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PGBD4Q96DM1 585 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MAP3K14Q99558 947 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RAB26Q9ULW5 256 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms