RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DCLK3Q9C098 648 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MED4Q9NPJ6 270 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PODXLO00592 558 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 IL1R2P27930 398 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PDE4CQ08493 712 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 KAZNQ674X7 775 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 HACE1Q8IYU2 909 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 HESX1Q9UBX0 185 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ADORA2BP29275 332 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PTK7Q13308 1070 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LPIN1Q14693 890 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 TRNP1Q6NT89 227 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 OSTM1Q86WC4 334 aa23.96■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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VSTM4-201ENST00000298454 ARL5CA6NH57 179 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 GRAP2O75791 330 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 GABBR2O75899 941 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ECEL1O95672 775 aa23.95■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 GYS2P54840 703 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 ZIM3Q96PE6 472 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 HSF2BPO75031 334 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 THP07101 528 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.95■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.95■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CYB561D2O14569 222 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CABYRO75952 493 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CETN2P41208 172 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SCNN1GP51170 649 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TAF5Q15542 800 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ODF2Q5BJF6 829 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ALS2CLQ60I27 953 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RNF169Q8NCN4 708 aa23.94■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 MIS12Q9H081 205 aa23.94■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 IQCKQ8N0W5 287 aa23.93■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 VPS18Q9P253 973 aa23.93■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.93■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.93■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.93■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RNF40O75150 1001 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFRAP16234 1089 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN2BP42772 138 aa23.92■■□□□ 1.42
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