RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 ATG13O75143 517 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 TADA3O75528 432 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PDGFRBP09619 1106 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 ME1P48163 572 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2J2P51589 502 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 LMNB2Q03252 620 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 EHHADHQ08426 723 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PSMD6Q15008 389 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC142Q17RM4 750 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA17Q96L03 361 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP45Q9UL16 551 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 USP18Q9UMW8 372 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-201ENST00000250495 HRO43593 1189 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 F13A1P00488 732 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CKMP06732 381 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 RETP07949 1114 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 GRIK1P39086 918 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CYP24A1Q07973 514 aa22.51■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 MTF1Q14872 753 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 LPAL2Q16609 132 aa22.51■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CGRRF1Q99675 332 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 SNX25Q9H3E2 840 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 EHD2Q9NZN4 543 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 TACC1O75410 805 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 TGM1P22735 817 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 BDNFP23560 247 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ANXA13P27216 316 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PDE6CP51160 858 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CYP27A1Q02318 531 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 TRPC3Q13507 836 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CPA6Q8N4T0 437 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 FRYLO94915 3013 aa22.49■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 LRP3O75074 770 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ARSAP15289 507 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PFKLP17858 780 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 HDCP19113 662 aa22.49■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 KCNB1Q14721 858 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 RESP18Q5W5W9 173 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 RIN3Q8TB24 985 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PCED1BQ96HM7 432 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 SLC22A12Q96S37 553 aa22.49■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.49■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 CASP1P29466 404 aa22.48■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 GJA4P35212 333 aa22.48■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.48■■□□□ 1.19
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-201ENST00000250495 EXOC3O60645 756 aa22.47■■□□□ 1.19
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