RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PTPN21Q16825 1174 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ZNF394Q53GI3 561 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PARM1Q6UWI2 310 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM35AQ86V20 835 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FGF14Q92915 247 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KCNK16Q96T55 309 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FANCLQ9NW38 375 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GDE1Q9NZC3 331 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ18B7U540 433 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 BEST1O76090 585 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CSH1P0DML2 217 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CSH2P0DML3 217 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GABRR2P28476 465 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CETN1Q12798 172 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ12Q14500 433 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MAN2A1Q16706 1144 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NT5C1BQ96P26 610 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.68■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 DCXO43602 365 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TADA3O75528 432 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A1P19634 815 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 USP46P62068 366 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 RRAGAQ7L523 313 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TTC39CQ8N584 583 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SMOQ99835 787 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NDST4Q9H3R1 872 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 OBSL1O75147 1896 aa23.67■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF10BO14763 440 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TRIM66O15016 1216 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FCARP24071 287 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ZXDAP98168 799 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 APBA1Q02410 837 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GCNT1Q02742 428 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 VWA3BQ502W6 1294 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM78AQ5JUQ0 283 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GCNT4Q9P109 453 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PTMSP20962 102 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PON1P27169 355 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 EDAQ92838 391 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NXPE3Q969Y0 559 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ASB16Q96NS5 453 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MED10Q9BTT4 135 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SIX2Q9NPC8 291 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TECTAO75443 2155 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.65■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 AP1G2O75843 785 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FGF19O95750 216 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ALADP13716 330 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ZNF18P17022 549 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F8P98187 520 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MYL5Q02045 173 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KCNMA1Q12791 1236 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GJB7Q6PEY0 223 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GBP6Q6ZN66 633 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 KRT82Q9NSB4 513 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 IL37Q9NZH6 218 aa23.64■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NCANO14594 1321 aa23.64■■□□□ 1.37
SYF2-201ENST00000236273 MYH10P35580 1976 aa23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms