RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 FETUBQ9UGM5 382 aa22.22■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 IL1BP01584 269 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-201ENST00000234111 RAG1P15918 1043 aa22.21■■□□□ 1.15
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ODC1-201ENST00000234111 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.19■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 NUP93Q8N1F7 819 aa22.19■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 FNDC8Q8TC99 324 aa22.19■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 RHBDL3P58872 404 aa22.18■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.18■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.18■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 SETDB2Q96T68 719 aa22.18■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 PICALMQ13492 652 aa22.17■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 RIN3Q8TB24 985 aa22.17■■□□□ 1.14
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